银杏品种遗传多样性的SRAP分析毕业论文

 2021-04-20 10:04

摘 要

:本文采用SRAP-PCR的标准反应体系(50μL):包含10×buffer( with Mg2 )5μL, TaqDNA聚合酶(5U/μL)0.25μL, dNTPs(各2.5mM)4μL,引物(10μM)2μL,模板DNA2.5ng。对88对SRAP引物进行初筛和复筛,最后选出多态性较丰富的9对SRAP引物对45个银杏品种进行遗传多样性分析,结果表明:PCR产物共产生78个清晰位点,其中60条多态性位点,多态性位点百分率为76.92%;45份银杏品种的遗传相似系数范围是0.53-0.93,当遗传相似系数取0.67时,供试材料分为四大类。

关键词: 银杏;SRAP标记;遗传多样性

Genetic Diversity Analysis of Ginkgo biloba varieties by SRAP

Abstract: In this paper, a appropriate SRAP-PCR system for ginkgo has been designed.It was: in 50μL reaction system, adding 10 × buffer (with Mg2 ) 5μL, TaqDNA polymerase 0.25μL, dNTPs4μL, primer 2μL, template DNA2.5ng. 9 pairs of polymorphic SRAP primer were chosed by preliminary screening and the secondary screening from 88 pairs of primer on SRAP to analyse the genetic diversity of forty-five varieties of ginkgo. The results showed that 9 pairs of primers generated 78 clear bands, in which there were 60 polymorphic bands, and the percentage of polymorphic bands was 76.92%.Genetic similarity coefficients among the forty-five varieties of ginkgo were from 0.53 to 0.93, and the cultivation were divided into four clusters when similarity coefficient was 0.67.

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字典

Key words: Ginkgo biloba;Sequence-related amplified polymorphism;Genetic diversity.

目录

前 言 - 1 -

1 文献综述 - 2 -

1.1 标记育种概况 - 2 -

1.2 分子标记 - 4 -

1.2.1相关序列扩增多态性(SRAP)标记 - 4 -

1.2.2 SRAP技术与主要分子标记技术的比较 - 5 -

2 材料与方法 - 8 -

2.1植物材料 - 8 -

2.2 实验试剂 - 9 -

2.3实验所需设备 - 9 -

2.4 实验方法 - 9 -

2.4.1 DNA的提取 - 9 -

2.4.2 DNA检测 - 10 -

2.4.3 SRAP-PCR反应体系及扩增程序 - 10 -

2.4.4 SRAP-PCR扩增产物的电泳检测 - 10 -

2.4.5 引物的筛选 - 11 -

2.4.6银杏品种PCR扩增及条带的统计和分析 - 11 -

3 结果与分析 - 12 -

3.1 DNA的提取 - 12 -

3.2 SRAP引物的筛选 - 12 -

3.3 SRAP-PCR扩增结果的多态性分析 - 12 -

3.4 45份银杏品种(系)的遗传多样性分析 - 13 -

4 结论与讨论 - 14 -

4.1银杏SRAP标记的扩增多态性及遗传多样性分析 - 14 -

4.2分子标记在银杏上的应用 - 15 -

致谢 - 16 -

参考文献: - 17 -

前 言

银杏是我国古老的树种,素有活化石之称,也是我国特有的树种之一,它本身更是个宝,集材用、食用、药用、观赏于一体,具有很高的经济价值与园林观赏价值。银杏品种繁多,但是没有统一的分类 ,而且仅从外观形态上区分开来却是费时费力。银杏为深根性树种,寿命很长,可达1000年以上。其生长缓慢,但是容易受到外界环境的影响,一般来说,在北京地区20年生的高6-7m;浙江天目山海拔500m处的林木,30年生的高10.6m。银杏发育缓慢,实生繁殖大概要20年才会开始开花结果,40年才会开始进入结实盛期,所以常用的繁殖方式是无性繁殖。由于不同地域间相互进行引种,使得同名异物或是同物异名的现象不胜枚举。而人们对于银杏品种的鉴定和分类是通过标记育种,而标记育种经历了一个漫长的发展过程,从只是单一的形态学标记再到细胞标记、生化标记再到现今流行的分子标记,人们对于植物的研究一直在不断的探索。分子标记已经深入到通过研究遗传物质DNA,从而为区分种质、连锁分析、基因定位、判定亲缘关系远近以及绘制基因图谱等提供有利的证据,作为基于DNA水平上的分子标记相较于其他标记育种,具有无可比拟的优越性,其结果真实可靠、不受外界环境以及内部发育状况的影响。近几年关于SRAP标记在动植物上的运用不胜枚举,比如苹果、鸭茅、番石榴、棉花[1]、花生[2]、狗牙根等等,但是关于银杏的研究还未见报道。本研究利用9对SRAP引物对45份银杏栽培品种进行遗传多样性分析,旨在揭示品种间的遗传差异,从而为开展银杏杂交育种提供依据。

1 文献综述

1.1 标记育种概况

标记育种是利用与目标性状基因紧密连锁的遗传标记,对目标性状进行跟踪选择的一项育种技术。遗传标记育种主要分为四种: 形态学标记、细胞学标记、生化标记和分子标记。早期遗传学是从性状表现传递的结果来推断遗传规律,建立遗传定律。在1923年,Sax等提出根据微效基因与主基因紧密连锁,从而对微效基因进行选择。但由于形态学标记数目有限,而且容易受到外界环境的影响,所以应用不广。细胞学标记主要依靠染色体核型和带型,数目有限。同工酶标记在过去一段时间得到了广泛的应用,但是它只能在一定程度上反映DNA组成上的差异和遗传多样性。因为它在基因表达后经过加工修饰,只能反映DNA多态性的一部分,而且它还容易受到外界环境和内部因素的影响。

现将四种标记育种的特性及其应用对比如表1,个中优劣不言自明,实际应用中常多种标记一起参考。

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